Fu costruita alla fine del XII secolo dai Cavalieri del Santo Sepolcro di Gerusalemme, che in seguito prese il nome dei Cavalieri di Malta. La Commenda a cui si accedeva direttamente dalla Chiesa di San Giovanni di Pré, funzionava come convento ed ostello per i pellegrini che giungevano a Genova e che da qui si imbarcavano per raggiungere la Terra Santa.
